水稻惡苗病的病菌在谷粒和稻草上越冬，次年使用了帶病的種子或稻草，病菌就從秧苗的芽鞘或傷口侵入，引起秧苗發(fā)病徒長。帶病的秧苗移栽后，把病菌帶到大田，引起稻苗發(fā)病。防治方法有農(nóng)業(yè)防治、生物防治及化學(xué)防治。
一、農(nóng)業(yè)防治：
（1）選用排灌方便的田塊，不用帶菌稻草作苗床的覆蓋物和扎秧草。
（2）不種植感病品種，選用抗病、無病、包衣的種子，如未包衣則用拌種劑或浸種劑。
（3）用無病土做苗床營養(yǎng)土，用藥土做播種后的覆蓋土。
（4）向大田移栽前，噴施一次除蟲的混合藥。
（5）肥料管理：提倡施用酵素菌漚制的或充分腐熟的農(nóng)家肥，采取“測土配方”技術(shù)，和“早促、中控、晚�！钡姆结�，重施基肥，科學(xué)施用氮肥，增施磷、鉀肥。加強田間管理，培育壯苗，增強植株抗病力，有利于減輕病害。
（6）水份管理：淺水勤灌，防止串灌；烤田適中。
（7）加強栽培管理，催芽不宜過長，拔秧要盡可能避免損根。做到“五不插”：即不插隔夜秧，不插老齡秧，不插深泥秧，不插烈日秧，不插冷水浸的秧。
（8）發(fā)現(xiàn)病株，及時拔除燒毀或高溫漚肥。
（9）防治該病的關(guān)鍵是種子和苗床。
二、生物防治：
10%抗菌劑401乳油1000倍液
80%抗菌劑402乳油8000倍液
以上藥劑浸種48～72小時（60小時效果），不需淘洗即可催芽。
三、化學(xué)防治：
（一）浸種劑：
（1）用70%甲基硫菌靈可濕性粉劑500倍液或25%施�？巳橛�2000倍液或強氯精可濕性粉劑500倍液或10%浸種靈乳油2500倍液，雜交稻種浸泡24小時，常規(guī)稻種浸種48～72小時（60小時效果），除強氯精浸種需要沖洗干凈外，其它不需淘洗即可催芽。
水溫要保持在16℃以上，不要用25％多菌靈WP。藥液的配制應(yīng)先在1個桶內(nèi)配制母液，水、藥分少量多次加入，充分攪拌后再加水，攪拌至少要15分鐘以上。
（2）用40%線菌清600倍液浸種24～36小時后，撈出用清水沖洗干凈，催芽、播種。
（3）用25％咪鮮胺乳油2000～3000倍液；或20％多森銨膠懸劑200倍液；或85％三氯異氰尿酸300倍液；或45％901可濕性粉劑500倍液等藥液浸種。種子處理前，早稻預(yù)浸種24小時，浸種48小時；晚稻預(yù)浸種12小時，浸種24小時，藥液量應(yīng)高于稻種表面30cm，消毒其間應(yīng)該攪拌若干次，撈出后科直接催芽或陰干后直接播種。
（二）藥土：1份殺菌劑+1份殺蟲劑+30份干細土混勻，做播種后的覆蓋土。
（三）噴施劑：
25%施�？巳橛�3000～4000倍液
95%綠亨1號（惡霉靈）可濕性粉劑3000～4000倍液
25%咪鮮胺水乳劑2000倍液+25％三唑酮可濕性粉劑1000～1500倍液
（播種前噴施苗床、發(fā)病時噴施植株）
四、制種田，母本齊穗至始花期噴施：
25%咪鮮胺水乳劑2000倍液+25％三唑酮可濕性粉劑1000～1500倍液，
能有效地抑制惡苗病菌侵染母本花器，同時還能減輕稻粒黑粉病的發(fā)生；成熟時還應(yīng)做到搶晴收曬，充分干燥，嚴防濕谷霉變、發(fā)芽，提高雜交稻種子質(zhì)量。