有機(jī)肥專指以各種動物廢棄物（包括動物糞便；動物加工廢棄物）和植物殘?bào)w（餅肥類；作物秸稈；落葉；枯枝；草炭等），采用物理、化學(xué)、生物或三者兼有的處理技術(shù)，經(jīng)過一定的加工工藝（包括但不限于堆制；高溫；厭氧等），消除其中的有害物質(zhì)（病原菌、病蟲卵害、雜草種籽等）達(dá)到化標(biāo)準(zhǔn)而形成的，符合國家相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)（NY 525-2012）及法規(guī)的一類肥料。
有機(jī)肥與化肥的區(qū)別在于生物有機(jī)肥做為新型環(huán)保型肥料，營養(yǎng)元素齊全，能夠改良土壤，改善使用化肥造成的土壤板結(jié)，能提高土壤肥力，使糧食作物、經(jīng)濟(jì)作物、蔬菜類、瓜果類大幅度增產(chǎn)，應(yīng)用前景非常廣闊。
（1）有機(jī)肥料含有大量的有機(jī)質(zhì)，具有明顯的改土培肥作用；化學(xué)肥料只能提供作物無機(jī)養(yǎng)分，長期施用會對土壤造成不良影響，使土壤“越種越饞”。
（2）有機(jī)肥料含有多種養(yǎng)分，所含養(yǎng)分全面平衡；而化肥所含養(yǎng)分種類單一，長期施用容易造成土壤和食品中的養(yǎng)分不平衡。
（3）有機(jī)肥料養(yǎng)分含量低，需要大量施用，而化學(xué)肥料養(yǎng)分含量高，施用量少。
（4）有機(jī)肥料肥效時間長；化學(xué)肥料肥效期短而猛，容易造成養(yǎng)分流失，污染環(huán)境。
（5）有機(jī)肥料來源于自然，肥料中沒有任何化學(xué)合成物質(zhì)，長期施用可以改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)；化學(xué)肥料屬純化學(xué)合成物質(zhì)，施用不當(dāng)能降低農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)。
（6）有機(jī)肥料在生產(chǎn)加工過程中，只要經(jīng)過充分的腐熟處理，施用后便可提高作物的抗旱、抗病、抗蟲能力，減少農(nóng)藥的使用量；長期施用化肥，由于降低了植物的免疫力，往往需要大量的化學(xué)農(nóng)藥維持作物生長，容易造成食品中有害物質(zhì)增加。
（7）有機(jī)肥料中含有大量的有益微生物，可以促進(jìn)土壤中的生物轉(zhuǎn)化過程，有利于土壤肥力的不斷提高；長期大量施用化學(xué)肥料可抑制土壤微生物的活動，導(dǎo)致土壤的自動調(diào)節(jié)能力下降。
PK結(jié)果，有機(jī)肥勝出。綜合比較上面的七條，有機(jī)肥除了第三條有機(jī)肥養(yǎng)分含量和化肥相比低一些，別的方面完勝化肥，因此我的建議是農(nóng)田施肥可以選擇有機(jī)肥。
生物有機(jī)肥與化肥的區(qū)別顯著，但亦可搭配使用。隨著科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，生物有機(jī)肥將是農(nóng)業(yè)發(fā)展的主要流行趨勢。
通過有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養(yǎng)技術(shù)，將有益菌群接入化處理后有機(jī)肥中，可以生產(chǎn)出多種多樣不同品種的生物有機(jī)肥 。也可謂是好處多多。
1、提高化肥的肥效
如過磷酸鈣等施入土壤后易被土壤固定而失效，與生物有機(jī)肥混合后施用，減少了化肥與土壤的接觸面，減少養(yǎng)分的固定，同時化肥也可以被生物有機(jī)肥吸收保蓄，減少養(yǎng)分流失。有機(jī)肥與化肥混用可取長補(bǔ)短，滿足作物各個生長期對養(yǎng)分的需要。
2、減少化肥施用后可能產(chǎn)生的副作用
單獨(dú)施用較大量化肥或化肥施用不均勻時，容易對作物產(chǎn)生毒副作用，如長期施用生理酸性肥料，會使土壤變酸，產(chǎn)生過多的活性鐵、活性鋁等有毒物質(zhì)，如過多游離的過磷酸鈣，作種肥時會影響種子發(fā)芽和幼苗生長，若與生物有機(jī)肥混合后施用，則不會發(fā)生此類問題。
3、增加作物養(yǎng)分
化肥只能為作物提供一種或幾種養(yǎng)分，長期施用，作物會產(chǎn)生缺素癥。生物有機(jī)肥所含養(yǎng)分全面，肥效穩(wěn)而長，含有大量的有益微生物和有機(jī)質(zhì)，能夠改善土壤理化性質(zhì)和微生物區(qū)系，增強(qiáng)土壤中酶的活性，有利于養(yǎng)分轉(zhuǎn)化。
4、克服肥料滲透壓
一般化肥溶解度大，施用后對土壤造成較高的滲透壓，影響作物對養(yǎng)份和水份的吸收，增加養(yǎng)份流失的機(jī)會。如與有機(jī)肥搭配混用，能克服這個弊端，促進(jìn)作物對養(yǎng)份和水份的吸收。
5、調(diào)節(jié)土壤酸堿度
如果堿性土壤單一施酸性化肥，銨被植物吸收后，剩下的酸根與土壤中氫離子結(jié)合生成酸，會導(dǎo)致酸性增強(qiáng)，土壤板結(jié)加劇。如與有機(jī)肥搭配混用，能提高土壤的緩沖能力，有效地調(diào)節(jié)酸堿度，使土壤酸性不至增高。
6、提高土壤活力
因?yàn)橛袡C(jī)肥是微生物生活的能源，化肥是供給微生物生長發(fā)育的無機(jī)營養(yǎng)。兩者混用能促進(jìn)微生物的活力，進(jìn)而促進(jìn)有機(jī)肥的分解。
土壤微生物的活動還能產(chǎn)生維生素，生物素，煙堿酸等，增加土壤養(yǎng)份，提高土壤活力，促進(jìn)作物的生長。